Об участии ФГБУ «ВНИИКР» в заключительной встрече по международному проекту EUPHRESCO II – SENDO

15-16 апреля 2014 г. в Шотландском научно-исследовательском институте сельского хозяйства (Science and Advice for Scottish Agriculture – SASA) состоялась заключительная встреча в рамках Европейской Программы по координации европейских фитосанитарных исследований EUPHRESCO II – SENDO «Диагностика Synchytrium endobioticum и идентификация патотипов возбудителя». Российскую сторону представлял заведующий лабораторией вирусологии ФГБУ «ВНИИКР» Ю.А. Шнейдер. Наряду с Россией в проекте принимали участие 14 исследовательских организаций из разных стран.

Основная цель EUPHRESCO II – SENDO – усовершенствование методов диагностики возбудителя рака картофеля и дифференциация его патотипов (1 (D1), 2 (G1), 6 (O1), 18 (T1), 38 (Nevsehir)). Длительность научно-исследовательских работ проекта составила 2 года (начиная с марта 2012 года). Однако большой объем данных, полученных участниками по разным методам диагностики S. endobioticum и дифференциации патотипов, поставил вопрос о продолжении проекта и переносе его в EUPHRESCO III.

На встрече участниками были сделаны доклады по нескольким направлениям: итоги биопроверки патотипа 8 (F1) S. endobioticum, результаты ринг-теста классической полимеразной цепной реакции (ПЦР) и ПЦР «в реальном времени» для идентификации S. endobioticum, результаты работ по полногеномному секвенированию патотипа 1 (D1) и других патотипов патогена.

Биопроверка возбудителя рака картофеля на разных сортах данной культуры позволила определить сорт растения-хозяина Gawin, который показал наибольшую устойчивость ко всем патотипам. Участники встречи рассмотрели вопрос о внесении данного сорта в стандарт PM 7/28 ЕОКЗР как самого устойчивого к S. endobioticum.

Специалист из Нидерландов Барт Ван де Воссенберг представил данные о применении молекулярных методов для идентификации возбудителя, результаты валидации разработанных методов. Было отмечено, что применение современных методов диагностики позволяет достоверно различать патотипы S. endobioticum, в то время как классические методы идентификации не всегда справлялись с данной задачей. Барт Ван де Воссенберг внес предложение о внесении ПЦР как метода для идентификации возбудителя рака картофеля в стандарт ЕОКЗР PM 7/28.

Также в рамках встречи была организована экскурсия в картофельное хранилище SASA и продемонстрировано, как проходит искусственное заражение клубней суспензией из зооспор S. endobioticum в лабораторных условиях.